До Державної думи належав терпимо, йшов компроміси з партіями представленими у ній, але особливих сподівань, що вони зможуть ефективно приймати закони для країни, П. А. Столипін не покладав.
26 квітня 1906 року імператор Микола II запропонував Столипіну посаду міністра внутрішніх справ Росії. Незабаром після цього взимку 1907 року уряд було розпущено разом із Державною думою I скликання, а Столипін того ж року було призначено головою Ради міністрів.
Аграрна реформа Столипіна не була «таблеткою» від гострого болю – вона була розрахована на десятиліття. Її головною метою було врегулювати, мабуть, найбільш животрепетне і назріле питання – питання селянського права та селянської власності в Росії.
Основна суть столипінської аграрної реформи полягала у тому, щоб, скасувавши викупні платежі, що залишилися, дати можливість усім селянам право вільно виходити з громади і закріплювати за собою надільну землю в спадкову приватну власність.