Препарат застосовують щодня 1 раз на добу. При кандидозі слизових оболонок рекомендована доза флуконазолу становить 3 мг/кг на добу. У перший день може бути призначена ударна доза 6 мг/кг з метою швидшого досягнення рівноважних концентрацій.
При розвитку вагінального кандидозу достатньо застосування однієї капсули препарату у дозі 150 мг. Ліки можна пити у будь-який час доби незалежно від їди, запиваючи достатньою кількістю води.
При гострому вагінальному кандидозі, кандидозному баланіті препарат застосовують одноразово внутрішньо у дозі 150 мг. Для зниження частоти рецидивів вагінального кандидозу препарат можна застосовувати у дозі 150 мг через кожні три дні – всього 3 дози (1, 4 та 7 день), потім підтримуюча доза 150 мг один раз на тиждень.
При лікуванні вагінального кандидозу призначається по 150 мг один раз на день, а для профілактики повторного виникнення може застосовуватись у цій же дозі щомісяця. Таблетки та капсули флуконазолу потрібно ковтати повністю, не розжовуючи, запиваючи достатньою кількістю води незалежно від їди.