Прийом у Ставропольську духовну семінарію здійснюється на конкурсній основі за результатами Єдиного державного іспиту (російська мова, історія, суспільствознавство) та додаткових вступних випробувань творчої та професійної спрямованості, що проводяться СтДС.
Щоб вступити до духовну семінарію, абітурієнти здають іспит з Закону Божого. Найчастіше їм пропонують написати твір, пов'язаний із якоюсь подією з історії православної церкви. Після іспиту вступники проходять співбесіди.
У Семінарію приймаються особи православного віросповідання чоловічої статі віком від 18 до 35 років (на заочну форму навчання – до 55 років), які мають середню або вищу освіта, неодружені або одружені першим шлюбом.
Вступити до духовної семінарії на денну форму навчання може будь-який православний християнин віці від 18 до 35 років. На пасторському відділенні можуть навчатися тільки неодружені чоловіки або одружені.