За результатами проходження призовником КМО призовна комісія суб'єкта РФ виносить своє рішення і може скасувати рішення районного військкомату. Строк розгляду становить 5 днів із дня звернення та передбачено законодавством.
Процес його проходження ідентичний проходженню медкомісії у військкоматі. У призначений день призовники прибувають на огляд та проходять стандартний медичний огляд. Контрольна медкомісія складається з терапевта, стоматолога, окуліста, хірурга, оториноларинголога, психіатра, невропатолога.
Далі процедура КМО повністю дублює процедуру медичного огляду у нижчестоящій комісії, а саме потрібно пройти ВСІХ лікарів. Лікарі повинні оформити листи медичного огляду, завірені копії яких призовник може отримати на письмову вимогу.