Комбінований препарат показаний для інтравагінального застосування при інфекціях, викликаних трихомонадами, та для попередження мікозів піхви, які часто розвиваються після застосування метронідазолу Препарат можна застосовувати при первинному мікозі піхви.
Місцеве лікування вагінітів змішаної етіології, спричинених одночасно Trichomonas spp. та Candida spp.
Покази препарату Кліон–Д 100 місцеве лікування вагінітів змішаної етіології, спричинених одночасно Trichomonas spp. та Candida spp.
Покази препарату Кліон протозойні інфекції: позакишковий амебіаз (у т. ч. амебний абсцес печінки), кишковий амебіаз (амебна дизентерія), трихомоніаз; інфекції, що викликаються Bacteroides spp.