Препарат застосовується перорально в дозі 50 мг/кг/добу на 3–4 прийоми.. У середньому дорослим призначається по 6–8 таблеток на добу, дітям – по 1 таблетці на 10 кг маси тіла. При тяжкій формі захворювання доза може бути збільшена до 100 мг/кг/добу та поділена на 4–6 прийомів. Тривалість терапії – 7-10 днів.
Дорослим – по 6-8 таблеток на добу, дітям – по 1/2 таблетки на 5 кг/маси тіла на добу. При В тяжких формах інфекційних захворювань доза може бути збільшена індивідуально до 100 мг/кг маси тіла на добу, розділених на 4-6.
Таблетки приймають після їди, запиваючи невеликою кількістю води. Рекомендована добова доза для дорослих та дітей віком 3 років і старше (з масою тіла від 15-20 кг) становить 50 мг/кг маси тіла у 3-4 прийоми (для дорослих – 6-8 таб./добу, для дітей – по 1/2 таблетки на 5 кг маси тіла/добу).
Ізопринозин, як і інші противірусні засоби, найбільш ефективний при гострих вірусних інфекціях, якщо лікування розпочато на ранній стадії хвороби (переважно з першої доби захворювання). Після двох тижнів застосування препарату слід провести контроль концентрації сечової кислоти у сироватці крові та сечі.